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jueves, septiembre 29, 2022

Un solo genotipo del coronavirus gener? el 60% de los casos en la primera semana de marzo

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Redacción.-

Un trabajo del consorcio SeqCovid-Spain, liderado por investigadores del CSIC, ha recogido muestras del genoma del virus procedente de 30 hospitales de toda Españaña.

Un equipo de investigadores con participaci?n del Consejo Superior de Investigaciones Cient?ficas (CSIC) ha publicado un informe?que muestra el mapa de la diversidad gen?mica del SARS-CoV-2, causante de la Covid-19, durante los primeros tres meses de la epidemia (de febrero a abril), es decir, el periodo denominado como primera ola.

El estudio ha observado que la diversidad gen?mica del coronavirus en Españaña es única en Europa, y más cercana a los genotipos del virus circulantes en Asia entre finales de 2019 y principios de 2020. Este hecho concuerda con la introducci?n temprana del virus en el pa?s, sobre todo a partir de la segunda mitad de febrero de 2020, y con una expansi?n muy veloz a todo el territorio nacional para finales de febrero.

Este informe es fruto del trabajo de investigadores del consorcio SeqCovid, liderados por el investigador del CSIC I?aki Comas, del Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV-CSIC), y la vir?loga?Mireia Coscolla, del Instituto de Biolog?a Integrativa de Sistemas (I2SysBio) del CSIC y la Universitat de Val?ncia; junto con?Fernando Gonz?lez Candelas,?responsable de la Unidad Mixta de Investigaci?n en Infecci?n y Salud P?blica de la Fundación para el Fomento de la Investigaci?n Sanitaria y Biom?dica (FISABIO) de la Generalitat Valenciana.

El consorcio SeqCovid-Spain a?na los esfuerzos de más de treinta hospitales de toda Españaña, as? como de laboratorios de gen?mica y salud pública. Como resultado, Españaña es ahora mismo el segundo pa?s de Europa con más muestras del genoma del virus recogidas, y el cuarto del mundo, con un total de 4.244 secuencias, de las cuales el consorcio ha secuenciado 3.800. Gran parte del esfuerzo de secuenciaci?n se realiz? en las instalaciones de la fundación FISABIO pero tambi?n en diversos hospitales de Españaña, entre los que se encuentran el Hospital General Universitario Gregorio Mara??n de Madrid, el Hospital Cl?nic de Barcelona, el Centro de Investigaci?n Biom?dica de La Rioja, el Hospital San Pedro de Logro?o, el Hospital de Elche y el Hospital Universitario Son Españases de Palma de Mallorca. El consorcio está financiado por la PTI Salud Global del CSIC y por el Instituto de Salud Carlos III, como mayor contribuyente.

Los an?lisis cient?ficos identifican un m?nimo de 519 entradas en el pa?s dentro de las 2.170 secuencias del principio de la epidemia analizadas. No todas esas entradas tuvieron ?xito epidemiol?gico; solo unas pocas llegaron a generar un número sustantivo de casos. Sin embargo, las pocas que cuajaron tuvieron un gran peso en la epidemia.

?Entre las secuencias analizadas se ha identificado un genotipo que gener? el 30% de todos los casos secuenciados, llegando a representar un 60% en la primera semana de marzo?, indica Comas. ?Una reconstrucción detallada de dicho genotipo demuestra que se introdujo m?ltiples veces y simult?neamente desde Italia, por lo menos en Madrid y Valencia, antes de que el pa?s transalpino diera la voz de alarma?, a?ade.

?Al ?xito de estas introducciones contribuyeron eventos de superdispersi?n, como un funeral en Vitoria, que ayudaron a este genotipo concreto a mantenerse y expandirse r?pidamente?, precisa el investigador. ?La alta movilidad entre provincias españolas hizo el resto para que el genotipo se convirtiera en el más exitoso de la primera ola en Españaña?, indica.

Un confinamiento eficaz para atajar la propagaci?n

Los an?lisis tambi?n demuestran la alta efectividad del confinamiento durante marzo y abril, que prácticamente elimin? estos genotipos exitosos, ya que no se han vuelto a detectar en la segunda ola. ?De hecho, en la segunda ola se están viendo nuevos genotipos aparecer con patrones similares a los mencionados en este trabajo?, dice Comas.

El investigador advierte: ?Uno de los mensajes más importantes extra?dos del informe es la necesidad de tomar medidas de restricci?n a tiempo para contener estos genotipos antes de que se expandan y tengan un peso tan importante en la epidemia. Como ocurre en otras partes del mundo, al ?xito de estos genotipos contribuye una combinaci?n de m?ltiples introducciones asociadas a eventos de superdispersi?n y a una alta movilidad?.

Además, el informe sugiere la necesidad de implementar sistemas de vigilancia temprana que identifiquen la expansi?n de determinados genotipos localmente y entre provincias, de tal manera que se puedan tomar decisiones informadas sobre las actuaciones a realizar para contenerlos.

 

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